PHYLOGENETIC PROFILE OF ESCHERICHIA COLI CAUSING BLOODSTREAM INFECTION AND ITS CLINICAL ASPECT

Abstract

Escherchia coli merupakan satu dari bakteri yang paling sering ditemukan dalam infeksi aliran darah. Tujuan penelitian ini adalah
untuk mengeksplorasi profil filogenetik E. coli yang menyebabkan infeksi aliran darah dan aspek klinisnya. Ini merupakan penelitian
observasional yang melibatkan 12 subjek yang menderita infeksi aliran darah yang disebabkan oleh E.coli. Isolat klinis E.coli serta hasil
uji kepekaan antimikroba diperoleh dari metode kaldu microdilution otomatis. Data klinis diperoleh dari rekam medis dan analisis
filogenetik yang dilakukan dengan polymerase chain reaction menggunakan gena chuA dan YjaA. Data dianalisis dengan menggunakan
statistik deskriptif. Sumber infeksi ini berasal dari saluran kemih, paru-paru, saluran pencernaan dan kulit yang ditemukan dalam 7
kasus. Namun, sumber infeksi tidak diketahui dalam 5 kasus. Sebagian besar subjek adalah pria dewasa dengan keganasan sebagai
penyakit yang mendasarinya. Escherichia coli sebagai etiologi infeksi aliran darah sebagian besar (75%) menghasilkan enzim ESBL dan
resistensinya terhadap antimikroba seperti ampicilin, ampicilin/sulbactam, ceftazidime, ceftriaxon, cefepime, aztreonam, ciprofloxacin
dan trimetropim-sulfamethoxazol yang cukup tinggi. Kelompok filogenetik dari isolat klinis ini sebagian besar (75%) adalah grup B2
dan grup D yang dikenal sebagai strain virulen ekstraintestinal. Isolat klinis yang tersisa (25%) dapat digolongkan sebagai kelompok
filogenetik A atau B1 dimana kelompok A dikenal sebagai strain komensal.